Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на этот документ:
https://elib.bsu.by/handle/123456789/289991
Заглавие документа: | ДИКЕТОНЫ ПРИРОДНОГО ПРОИСХОЖДЕНИЯ КАК ПОТЕНЦИАЛЬНЫЕ КОВАЛЕНТНЫЕ ЛИГАНДЫ БЕЛКОВ SARS-COV-2: ИССЛЕДОВАНИЕ IN SILICO МЕТОДОМ ДОКИНГА |
Другое заглавие: | NATURAL DIKETONES AS POTENTIAL COVALENT LIGANDS FOR SARS-COV-2 PROTEINS: AN IN SILICO DOCKING STUDY / Ya. V. Faletrov, V. A. Staravoitava, H. I. Pozniak, V. M. Shkumatov |
Авторы: | Фалетров, Я. В. Старовойтова, В. А. Позняк, Г. И. Шкуматов, В. М. |
Тема: | ЭБ БГУ::ЕСТЕСТВЕННЫЕ И ТОЧНЫЕ НАУКИ::Химия |
Дата публикации: | 2022 |
Издатель: | Belaruskaya Navuka |
Библиографическое описание источника: | Proc Nat Acad Sci Belarus, Chem Series 2022;58(3):280-285. |
Аннотация: | Компьютерный докинг, проведенный с использованием программы Autodock Vina, позволил выявить потенциал нескольких α- и β-дикетонов растений и других природных объектов в качестве ковалентных лигандов ряда белков коронавируса SARS-CoV-2 – возбудителя COVID-19. Выявлено, что энергией связывания (docking score, Ebind, ккал/мол) менее –7,5 с колоколизацией карбонильных групп на расстоянии не более 0,4 нм от атомов азота боковой цепи остатков аргинина белков коронавируса. β-Дикетоны 6-гингердион (код структуры по базе данных Pubchem CID162952), 8-гингердион (CID14440537), тетрагидрокуркумин (CID124072), а также α-дикетон валлитаксан E (CID132967478) обладали такими свойствами. Выявленные in silico взаимодействия указывают на возможность обнаружения их в эксперименте и исследования этих веществ или содержащих их природных материалов как средств борьбы с короновирусной инфекцией. |
Аннотация (на другом языке): | Our computer-aided protein-ligand docking test using Autodock Vina software allowed to reveal the potential of few α-and β-diketones from plants and alternative living organisms as covalent ligands for few proteins of coronavirus SARS-CoV-2 – a causative agent of COVID-19. It has been established that values for energy of binding (docking score, Ebind, kcal/mol) less than –7.5 and for distances of ligands’ carbonyl groups to side chain nitrogens of arginine residues of some coronaviral enzymes within 0.4 nm have been true for β-diketones 6-gingerdione (Pubchem code CID162952), 8-gingerdione (CID14440537), tetrahydrocurcumine (CID124072) as well as α-diketone wallitaxane E (CID132967478). The in silico revealed interactions are interesting to be verified in vitro and they point out a possibility of investigation of the compounds and related natural materials as tools for struggle against coronaviral infections. |
URI документа: | https://elib.bsu.by/handle/123456789/289991 |
DOI документа: | 10.29235/1561-8331-2022-58-3-280-285 |
Scopus идентификатор документа: | 85138738467 |
Финансовая поддержка: | Acknowledgements. The work was supported by BRFFR grant X19COVID-030. |
Лицензия: | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Располагается в коллекциях: | Статьи сотрудников НИИ ФХП |
Полный текст документа:
Файл | Описание | Размер | Формат | |
---|---|---|---|---|
738-1251-1-SM.pdf | 566,11 kB | Adobe PDF | Открыть |
Все документы в Электронной библиотеке защищены авторским правом, все права сохранены.