Сборка и аннотация митохондриального генома Macrosiphum albifrons essig – инвазивного в условиях Беларуси вида тли, и оценка применимости комбинативных молекулярных маркеров для построения филогении тлей : отчет о научно-исследовательской работе (заключительный) / БГУ ; научный руководитель С. С. Левыкина

Abstract

Объект исследования – митохондриальный геном тли M. albifrons. Цель работы – сборка и аннотация полного митохондриального генома M. albifrons, а также поиск наиболее подходящих сетов генов для последующего их применения в филогении тлей. Методы исследования: компьютерные, биоинформатические. В результате исследования было показано, что митохондриальный геном тли M. albifrons обладает предковой структурой. Самое высокое содержание аденин-тиминовых оснований было отмечено в области локализации D-петли, несколько ниже – в регионе повторов. Было смоделировано 22 вторичные структуры тРНК из стандартного набора, а также 7 изоформ тРНК, 6 из которых предположительно могут быть функциональны. Показано, что отсутствие функциональной шпильки, характерной для области D-петли, в регионе повторов не подтверждает теорию о функции данного участка как запасного источника инициации репликации. Подтверждено парафилетическое происхождение подсемейства Eriosomatinae. Был сделан вывод о том, что реконструкция филогении внутри трибы Macrosiphini требует увеличения числа доступных к исследованию митогеномов и привлечения дополнительных молекулярных маркеров. Митохондриальному геному M. albifrons был присвоен идентификационный номер в генетической базе данных GenBank – MW659868