Please use this identifier to cite or link to this item:
https://elib.bsu.by/handle/123456789/288563| Title: | Биоинформатический пайплайн по идентификации пептидов, пригодных для CAR-T терапии лейкозов |
| Other Titles: | Bioinformatics pipeline for identification of immunogenic peptides suitable for CAR-T therapy of leukemia / V.V. Grinev, I.M. Ilyushonak, V.A. Suchok, K.V. Huzava |
| Authors: | Гринев, В. В. Ильюшёнок, И. Н. Сучек, В. А. Гузова, Е. В. |
| Keywords: | ЭБ БГУ::ЕСТЕСТВЕННЫЕ И ТОЧНЫЕ НАУКИ::Кибернетика ЭБ БГУ::ТЕХНИЧЕСКИЕ И ПРИКЛАДНЫЕ НАУКИ. ОТРАСЛИ ЭКОНОМИКИ::Медицина и здравоохранение ЭБ БГУ::ТЕХНИЧЕСКИЕ И ПРИКЛАДНЫЕ НАУКИ. ОТРАСЛИ ЭКОНОМИКИ::Биотехнология |
| Issue Date: | 2022 |
| Publisher: | Минск : БГУ |
| Citation: | Информационные системы и технологии = Information Systems and Technologies : материалы междунар. науч. конгресса по информатике. В 3 ч. Ч. 2, Респ. Беларусь, Минск, 27–28 окт. 2022 г. / Белорус. гос. ун-т ; редкол.: С. В. Абламейко (гл. ред.) [и др.]. – Минск : БГУ, 2022. – С. 41-46. |
| Abstract: | Статья описывает разработку многокомпонентного пайплайна, нацеленного на идентификацию иммуногенных пептидов, пригодных для CAR-T терапии лейкозов человека. Принцип идентификации основан на реконструкции аномальных открытых рамок считывания мРНК из данных RNA-Seq. Поиск пептидов осуществляется либо через сборку транскриптома, либо на основе уже имеющегося эталонного набора транскриптов. Пайплайн сфокусирован на пептидах, которые образуются за счёт альтернативного сплайсинга нормальных генов, а не за счёт нарушения последовательности генов |
| Abstract (in another language): | The work describes the development of a multicomponent pipeline aimed at identifying immunogenic peptides suitable for CAR-T therapy of human leukemia. A principle of identification is based on reconstruction of abnormal open reading frames in mRNAs, captured by RNA-Seq. Searching of peptides can be performed by transcriptome assembly or with using a reference set of known RNAs. Our approach focused on peptides, derived from alternatively spliced RNAs of normal genes, nor mutated sequences of genes |
| URI: | https://elib.bsu.by/handle/123456789/288563 |
| ISBN: | 978-985-881-425-0 (ч. 2); ISBN 978-985-881-427-4 |
| Licence: | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Appears in Collections: | 2022. Информационные системы и технологии |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.