Гены иммунной системы в геноме тли Aphis сrассivоrа фауны Беларуси : отчет о научно-исследовательской работе (заключительный) / БГУ ; научный руководитель Р. С. Шулинский

Abstract

Объекты исследования – гены иммунной системы в геноме Aphis craccivora. Цель работы – проведение структурной и функциональной аннотации генов иммунной системы в геноме A. craccivora, а также установление структуры вышеуказанных генов и их продуктов. Материалы исследования: полногеномные сборки геномов тлей, доступные в международных базах данных нуклеотидных последовательностей, данные полногеномного секвенирования A. craccivora. Методы исследования: компьютерные, биоинформатические. В результате проведенного исследования в геноме A. craccivora было обнаружено 72 гена иммунной системы. Из них 33 – гены группы сигнализации, 10 генов группы деградации патогенов, 6 генов группы распознавания патогенов и 16 генов группы общего стресса. Анализ по генной онтологии показал, что функциональные группы сигнала межклеточной трансдукции, связывания ионов металлов и АТФ-связывающие преимущественно встречаются в геноме тли A. craccivora. Иммунная система вышеуказанного вида характеризуется обширной системой сигнализации в совокупности с преимущественно механизмами неспецифического иммунного ответа. Данные, полученные в ходе выполнения НИР, могут быть использованы в области сравнительной геномики, биоинформатики, молекулярной биологии.