Основы компьютерного моделирования биомолекул. № УД-5095/уч.

Abstract

Методы компьютерного моделирования пространственной структуры биомолекул являются важной частью структурной биологии, молекулярной биофизики и биохимии. Безусловно, не во всех случаях качество получаемых с их помощью моделей может быть достаточным для решения таких сложных задач, как направленное изменение функциональных свойств белков и дизайн новых биологически активных веществ, включая лекарства. Однако качество компьютерных моделей белков стремительно растет, и они все более активно используются для планирования лабораторных экспериментов и объяснения получаемых результатов, поиска новых антигенных детерминант и дизайна химерных/мутантных конструкций, предсказания функций и фармакологического потенциала мишени и идентификации активного сайта. В последние годы методы моделирования белков in silico стали полноправным партнером традиционных экспериментальных исследований. Совместное использование этих независимых и взаимодополняющих подходов способно дать реалистическое описание структурно-динамических свойств белков и расшифровать молекулярные механизмы их функционирования в норме и при различных патологиях.