Please use this identifier to cite or link to this item:
https://elib.bsu.by/handle/123456789/230845| Title: | Эпигенетические маркеры хроматина ассоциированы со сплайсингом РНК в лейкозных клетках человека |
| Other Titles: | Epigenetic marks on the chromatin are associated with RNA splicing in human leukemia cells / T. V. Ramanouskaya, A. V. Kviatko, V. V. Grinev |
| Authors: | Романовская, Т. В. Кветко, А. В. Гринев, В. В. |
| Keywords: | ЭБ БГУ::ЕСТЕСТВЕННЫЕ И ТОЧНЫЕ НАУКИ::Биология ЭБ БГУ::ТЕХНИЧЕСКИЕ И ПРИКЛАДНЫЕ НАУКИ. ОТРАСЛИ ЭКОНОМИКИ::Медицина и здравоохранение |
| Issue Date: | 2019 |
| Publisher: | Минск : БГУ |
| Citation: | Журнал Белорусского государственного университета. Биология = Journal of the Belarusian State University. Biology . - 2019. - № 2. - С. 70-81 |
| Abstract: | Изучена ассоциация между паттерном распределения различных эпигенетических маркеров и событиями сплайсинга на уровне полного генома и транскриптома в двух лейкозных клеточных линиях человека Kasumi-1 и SEM с двумя разными типами реципрокных хромосомных транслокаций. Показано, что многие эпигенетические маркеры, определяющие более открытое или закрытое состояние хроматина, распределены неодинаково в областях донорных и акцепторных, а также канонических и альтернативных сайтов сплайсинга экспрессирующихся генов. Маркеры открытого хроматина значимо чаще присутствуют в области участков с альтернативными событиями сплайсинга, чем в участках с каноническим сплайсингом, в то время как для маркера триметилирования гистона 3 по лизину в позиции 36 наблюдается противоположная тенденция. Полученные результаты вскрывают наличие дополнительного, пока еще очень плохо изученного слоя в регуляции альтернативного сплайсинга в клетках человека. |
| Abstract (in another language): | In this work we estimated associations between distribution patterns of several epigenetic marks and splicing events on the level of full genome and transcriptome in the cells of two leukemic cell lines containing two different reciprocal chromosome translocations. Significant difference in distribution of epigenetic marks was found, contributing to more opened or more closed chromatin in loci of donor vs acceptor and canonical vs alternative splice sites in expressing genes. Marks of the opened chromatin are significantly more often present in the genomic regions with alternative splicing events than in regions with canonical splicing, while for the mark of the histone 3 trimethylation at lysine 36, the opposite trend is observed. The obtained results reveal the presence of an additional, still very poorly studied layer in the regulation of alternative splicing in human cells. |
| URI: | http://elib.bsu.by/handle/123456789/230845 |
| ISSN: | 2521-1722 |
| DOI: | 10.33581/2521-1722-2019-2-70-81 |
| Licence: | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Appears in Collections: | 2019, №2 |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.