Построение системы распределенного моделирования динамических процессов в молекулярных системах

Abstract

Прогресс в области компьютерного моделирования открыл новые возможности для проведения исследований систем высокой сложности. Эти системы характеризуются значительным числом взаимодействую- щих компонентов (в свою очередь являющихся подсистемами), многооб- разием связей между своими компонентами, нелинейностью поведения и, как следствие, сложностью прогнозирования. Моделирование таких систем требуют для исполнения все большее и большее количество вы- числительных ресурсов, которые может предоставить только мультипро- цессорная и распределенная вычислительная техника. Именно поэтому достаточно актуальным является построение системы распределенного моделирования. Одним из примеров таких систем являются молекулярные системы, моделирование которых требует большой вычислительной мощности. В данной работе рассмотрен метод молекулярной динамики, в основе ко- торого лежит численный расчет траекторий движения частиц. Этот под- ход позволяет рассчитать любое свойство системы, как термодинамиче- ское, так и кинетическое, таким образом, предоставляя исчерпывающую информацию о системе.