Основы биоинформатики. № УД-770/25/р.

Abstract

Вычислительная биология, она же биоинформатика, она же компьютерная генетика - молодая наука, возникшая в начале 80-х годов на стыке молекулярной биологии и генетики, математики (статистики и теории вероятности) и информатики, испытавшая влияние лингвистики и физики полимеров. Толчком к этому послужило появление в конце 70-х годов быстрых методов секвенирования последовательностей ДНК. Нарастание объема данных происходило лавинообразно и довольно скоро стало ясно, что каждая полученная последовательность не только представляет интерес сама по себе (например, для целей генной инженерии и биотехнологии), но и приобретает дополнительный смысл при сравнении с другими. Под биоинформатикой понимают науку, занимающуюся анализом экспериментальных данных молекулярной биологии: секвенированных последовательностей биополимеров, экспериментально определенных пространственных структур биологических макромолекул, данных об экспрессии генов и т.д. Методами биоинформатики являются методы организации информации, широко понимаемые компьютерные методы, методы вычислительной математики и статистики. Курс «Основы биоинформатики» рассчитан на слушателей, не обладающих знаниями в области биоинформатики и молекулярной биологии, но являющимися уверенными пользователями ПК. Биоинформатика рассматривается как комплекс подходов к анализу данных получаемых в биологических экспериментах. В рамках курса обсуждаются большинство биоинформационных задач актуальных на сегодняшний день, одновременно студенты разбирают конкретные задачи биологии, возникшие при переходе из аналогового в цифровой формат. Цель курса - получение студентами основополагающих сведений о содержании и возможностях информационной биологии (биоинформатики), возможностях приложения методов информационной биологии, в том числе, теоретического анализа и компьютерного моделирования, к решению фундаментальных и прикладных проблем молекулярной биологии, молекулярной генетики, клеточной биологии, биомедицины и задач, возникающих на стыке этих наук с математикой, информатикой и физикой.