Автоматический анализ изменений внутри подвижных клеток по изображениям

Abstract

In this paper an algorithm for determining of characteristics of cell movement is was proposed. This algorithm is based on analysis of sequence of microscopic images. The algorithm allows to select the skeleton of optical flow, which coincides with the cytoskeleton of cells. The algorithm is make it possible to estimate the mobility of intracellular fragments, determine the direction of their movement and gets more information about processes occurring inside the cell. The algorithm is optimized significantly, since the computation of optical flow works not for the whole image, but only for the informative piece. = Предлагается алгоритм определения характеристик движения клетки на основе анализа последовательности микроскопических изображений. Алгоритм позволяет выделить скелет оптического потока, который совпадает с положением цитоскелета клетки. В результате появляется возможность оценить подвижность внутриклеточных фрагментов, рассчитать направление их движения и получить дополнительную информацию о процессах, происходящих внутри клетки. Алгоритм заметно оптимизирован, так как основные затраты времени приходятся на вычисление оптического потока, а данная часть алгоритма работает не с целым изображением, а только с информативным фрагментом.