Please use this identifier to cite or link to this item:
https://elib.bsu.by/handle/123456789/342235| Title: | Комплексный анализ флуктуаций интенсивности флуоресценции молекулярных соединений |
| Other Titles: | Complex analysis of fluorescence intensity fluctuations of molecular compounds |
| Authors: | Яцков, Н.Н. Скакун, В.В. Недервин-Шипперс, Л. Кортхольт, А. Апанасович, В.В. |
| Open Researcher and Contributor ID: | 0000-0003-0880-4188 |
| Keywords: | ЭБ БГУ::ЕСТЕСТВЕННЫЕ И ТОЧНЫЕ НАУКИ::Физика ЭБ БГУ::ЕСТЕСТВЕННЫЕ И ТОЧНЫЕ НАУКИ::Математика |
| Issue Date: | 2020 |
| Publisher: | Институт физики им. Б.И. Степанова НАН Беларуси |
| Citation: | Журнал прикладной спектроскопии. 2020;87(4):628-636 |
| Abstract: | Предложен метод комплексного анализа флуктуаций интенсивности флуоресценции молекулярных соединений, позволяющий определять структурный состав олигомеров белков. Идея метода состоит в анализе гистограмм числа фотоотсчетов экспериментальных измерений с применением метода главных компонент для оценки наличия олигомерных соединений и иерархического кластерного анализа для определения классов данных, соответствующих различным молекулярным соединениям, с последующим выделением медоидов кластеров для нахождения параметров олигомерного состава белковых комплексов. Эффективность алгоритмов анализа, разработанных в рамках реализации предложенного метода, подтверждена на смоделированных и экспериментальных гистограммах числа фотоотсчетов измерений флуктуаций интенсивности флуоресценции мономерных и димерных форм белка GFP. |
| Abstract (in another language): | A method is proposed for the complex analysis of fluctuations in the fluorescence intensity of molecular compounds, which allows determining the structural composition of protein oligomers. The idea of the method is to analyze the photon counting histograms of experimental measurements using principal component analysis to assess the presence of oligomeric compounds, and to perform hierarchical cluster analysis, to determine the data classes corresponding to various molecular compounds, followed by selecting cluster medoids to determine the oligomeric composition of protein complexes. The efficiency of the analysis algorithms developed within the framework of the proposed method was confirmed on simulated and experimental photon counting histograms of the measured fluorescence intensity fluctuations of monomeric and dimeric forms of green fluorescent protein (GFP). |
| URI: | https://elib.bsu.by/handle/123456789/342235 |
| Licence: | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Appears in Collections: | Кафедра системного анализа и компьютерного моделирования. Статьи |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| 673-918-1-SM.pdf | 338,66 kB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.