Эволюция генов устойчивости к инсектицидам у тлей Acyrthosiphum caraganae : отчет о научно-исследовательской работе (заключительный) / БГУ ; научный руководитель Р. С. Шулинский

Abstract

Объект исследования: Геном тли Аcyrthosiphum caraganae. Целью работы является аннотация генома А. caraganae и анализ его на наличие белков системы детоксикации. Методы: компьютерные, биоинформатические. В результате было найдено 102 белка из которых : 36 АТФ-связывающих кассет подсемейств A, B, C, E, F, G; 22 ABC-транспортера семейств G, F, H; 44 белка, ассоциированных с множественной лекарственной устойчивостью. Дана количественная характеристика ABC транспортеров во всех геномах тлей, доступных в RefSeq. Самыми многочисленными являются белки G-семейства, которые потенциально могут отвечать за детоксикацию основных вторичных метаболитов растений. Проведен филогенетический анализ, по результатам которого выявлено три крупных кластера. Так же в последовательностях было обнаружено 3 консервативных мотива, которые идентифицированы во всех изучаемых последовательностях. Установлено, что трехмерная структура ABC-транспортера G-семейства, которая представляет собой типичную структуру АТФ-связывающих кассет, состоит из чередующихся трансмембранных доменов совместно с каталитическими ABC-доменами.