Идентификация и филогенетический анализ генов ДАГФ-синтаз II типа 2-ого подтипа у бактерий рода Pseudomonas : отчет о научно-исследовательской работе (заключительный) / БГУ ; научный руководитель Е. Г. Веремеенко

Abstract

Объект исследования: геном бактерии Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantiaca. Цель работы: проведение скрининга и филогенетического анализа вариантов генов ДАГФ-синтаз II типа у бактерий рода Pseudomonas с последующей идентификацией функциональной роли каждого из продуктов в регуляции ароматического метаболизма. Методы проведения НИР: молекулярно-генетические. Результаты проекта и их новизна: секвенированы и собраны полные геномы бактерий-мутантов P. chlororaphis subsp. aurantiaca В-162/2, В-162/17, В-162/225, способных к повышенному синтезу феназиновых антибиотиков, а также штамма дикого типа. Сравнительный анализ вышеописанных сиквенсов геномов мутантных бактерий с геномом бактерии дикого типа продемонстрировал отсутствие мутаций в генах ДАГФ-синтаз у штаммов-продуцентов. Анализ уровня экспрессии гена phzC (кодирует ДАГФ-синтазу II типа 1-ого подтипа) показал наличие экспрессии на всем протяжении роста бактериальной культуры, тогда как ген, кодирующий ДАГФ-синтазу II типа 2-ого подтипа, экспрессируется в самом начале роста культуры и вновь активизируется только на 6-ой день культивирования. Показано, что гены феназинового оперона экспрессируются не совместно, а несколькими группами, что отличается от установленных правил для генов оперонов. Данные итоги получены впервые и имеют высокую научную значимость. Область применения: медицина, сельское хозяйство, биосенсорика и биотехнология. Рекомендации по внедрению выводов: внедрение в учебный процесс в Республике Беларусь. Экономическая эффективность работы: полученные результаты будут использованы для проведения исследований в рамках ГПНИ. Прогнозные предположения о развитии объекта исследования: планируется определение количественного уровня экспрессии для штаммов-мутантов, а также штамма дикого с дальнейшей разработкой методических рекомендаций для увеличения синтеза феназиновых антибиотиков.