Молекулярно-генетический анализ acdS-гена бактерий Pseudo-monas putida B-37

Abstract

C помощью полимеразной цепной реакции осуществлен скрининг коллекции бактерий рода Pseudomonas на наличие гена acdS, кодирующего фермент АЦК-дезаминазу. Отмечается, что данный фермент является ингибитором синтеза стрессового этилена, пагубно влияющего на рост и развитие растений. У трех (P. putida B-37, P. putida B-28 и P. putida KT 2442) из пяти исследованных штаммов ризосферных бактерий обнаружен ПЦР-продукт необходимого размера (около 1000 пар нуклеотидов). Определена первичная нуклеотидная последовательность изучаемого фрагмента бактерий P. putida B-37, проведен ее анализ in silico. Сделан вывод о том, что данная последовательность соответствует acdS-гену, который кодирует полноценный функциональный белок, являющийся АЦК-дезаминазой. Использование АЦК-дезаминазы позволит снизить уровень стрессового этилена и уменьшить негативное влияние, оказываемое на растения различными факторами окружающей среды. = In current work PCR-screening of bacterial collection of genus Pseudomonas was made with the purpose to check the presence of acdS gene which is coding enzyme ACC deaminase. ACC deaminase can inhibit synthesis of stress ethylene that is harmful for the growth and development of plants. This gene was observed among three of five bacterial strains (P. putida B-37, P. putida B-28, P. putida KT 2442). Nucleotide sequence of the fragment corresponding to acdS gene of P. putida B-37 was taken and analyzed in silico. As a result, it was proven that there is acdS gene and it codes the protein ACC deaminase. Using of ACC deaminase will lead to increasing of stress ethylene level and negative influence on the plants of different environmental factors.