Клонирование, секвенирование и генетическая аннотация hrp′-dsp-кластера фитопатогенных бактерий Erwinia carotovora subsp. atroseptica

Abstract

Геном бактерий Eca содержит эффекторный локус, состоящий из дивергентно транскрибируемых оперонов dspEF и hrpWshcW. Каждый оперон содержит протяженный ген потенциального эффектора, за которым следует небольшой ген, продукт которого скорее всего является специфичным для этого эффектора шапероном. Структура локуса свидетельствует о тесной координации экспрессии генов в каждом опероне. Транскрипция генов локуса инициируется с расположенных перед первым геном каждого оперона HrpL-зависимых промоторов (внутренние промоторы не детектируются). Кроме того, расположение старт-кодона shcW непосредственно за стоп-кодоном hrpW свидетельствует о возможности сопряженной трансляции этих генов.