Клонирование гена белка капсида белорусского штамма цирковируса свиней 2 типа

Abstract

A group of 69 porcine circovirus type 2 strains genomes from the GenBank sequence database were analyzed to obtain a con- sensus sequence and to build a dendrogram to estimate a genetic identity of PCV2 strains circulating in different geographic regions. Two pairs of primers were constructed to isolate a Belarusian PCV2 strain capsid protein gene from the lymph node tissue sample of the pig infected with PCV2 and revealing clear symptoms of porcine multi-systemic wasting syndrome. The amplificated cap-sid protein gene was ligated into the cloning pUC18 vector and sequenced after that. The strain was conсluded to belong to the PCV2b genotype based on the nucleotide signature motif structure of the capsid protein gene. = Проанализированы последовательности геномов группы штаммов цирковируса свиней 2 типа (ЦВС-2) из базы данных нуклеотидных последовательностей GeneBank. По результатам множественного выравнивания последовательностей геномов исследованных штаммов построено их филогенетическое древо и определена консенсусная последовательность генома, на основе которой разработаны две пары праймеров, использованных в работе для амплификации области генома белорусского штамма ЦВС-2. Амплифицированный фрагмент, содержащий последовательность гена белка капсида вируса, был клонирован в векторе pUC18 и секвенирован. Результаты анализа сиквенса подтвердили принадлежность клонированной последовательности к гену белка капсида ЦВС-2 и позволили на основании структуры консервативного белкового мотива отнести хозяина последовательности ЦВС-2 к филогенетической группе ЦВС-2b.